단기 계약직 종료 후 중도퇴사 연말정산 처리 가이드



단기 계약직 종료 후 중도퇴사를 하면 “연말정산을 누가 어떻게 처리해야 하나” 고민이 커지는데, 2026년 기준으로는 퇴사 시점에 회사에서 중도퇴사자 연말정산을 먼저 해주고, 공제받지 못한 부분은 재취업 여부에 따라 새 회사에서 정산하거나 5월 종합소득세 신고로 마무리하는 구조가 핵심입니다. 이 글에서는 단기 계약직·계약 기간 종료 후 중도퇴사자를 기준으로, 실제 사례를 바탕으로 한 연말정산 처리 가이드를 단계별로 정리해 드립니다.

 

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😰 단기 계약직 중도퇴사 후 연말정산, 왜 헷갈릴까?

많은 단기 계약직 근로자들이 1~2개월만 일해도 “연말정산을 받아야 하는지”, “퇴사 후 돈을 더 돌려받을 수 있는지”를 알기가 어렵습니다. 국세청 기준으로는 1년 미만 근무라도 4대 보험에 가입되고 근로소득세가 원천징수된 경우, 연말정산 대상입니다. 다만 중도퇴사자는 회사에서 기본 공제 위주만 처리해 두고, 나머지는 이후 재취업 여부에 따라 추가 정산하는 구조라서 정보가 불완전하게 느껴지는 편입니다.

가장 많이 하는 실수 3가지

  • 퇴사할 때 원천징수영수증을 신청하지 않고 떠나는 것
  • 이직 후에도 전 회사 영수증을 제출하지 않아 합산 공제를 놓치는 것
  • 재취업 없이 휴직 상태일 때, 5월 종합소득세 신고를 놓치는 것

왜 이런 문제가 생길까요?

단기 계약직은 1~2개월 근무 후 계약이 끝나기 때문에, 회사는 “연말정산 간소화 서비스가 열리기 전”이라서 세부 공제 자료를 반영하기 어렵습니다. 그래서 퇴사 시점에는 근로소득공제, 기본공제, 표준세액공제 등만 기본으로 정산하고, 나머지 공제는 근로자 본인이 이후 절차를 통해 추가로 받는 구조입니다. 이 과정에서 퇴사자 입장에서 “이미 끝났다”고 생각하는 경우가 많아 세금 환급을 놓치기 쉽습니다.

📊 2026년 단기 계약직 중도퇴사, 연말정산 핵심만 빠르게

2026년에는 2025년 근로소득을 기준으로 연말정산을 하며, 단기 계약직이라도 1년 중 한 달이라도 3.3% 원천징수 또는 4대 보험에 가입된 근로자는 1~2월 연말정산 또는 5월 종합소득세 신고 대상입니다. 특히 중도퇴사자는 퇴사월 급여 정산 시점 중도퇴사자 연말정산 + 재취업 후 현 회사 연말정산 또는 5월 종합소득세 신고 중 한 가지 경로를 선택하게 됩니다.

※ 아래 ‘함께 읽으면 도움 되는 글’도 꼭 확인해 보세요.

꼭 알아야 할 필수 정보(체크리스트)

  • 퇴사 시 근로소득 원천징수영수증을 반드시 받거나, 이후 홈택스에서 출력
  • 재취업한 경우 2026년 1~2월 현 회사 연말정산에 전 직장 영수증 제출
  • 재취업 없이 휴직 중인 경우 2026년 5월 종합소득세 정기 신고로 공제 추가
  • 퇴사 전·재취업 전 사용한 신용·체크카드, 월세, 보험료 등은 근로기간에 지출한 경우만 공제 가능

단기 계약직·중도퇴사자 연말정산 유형 비교표

단기 계약직·중도퇴사자 연말정산 유형 비교
구분 신고 시기 신고 주체 필수 준비물 장점
재취업 성공 (재직 중) 2026년 1~2월 현 근무 회사 전 직장 원천징수영수증, 공제 서류 회사에서 합산 정산, 번거로움 최소화
휴직 중 (미취업) 2026년 5월 (종합소득세) 본인 직접 홈택스 간소화 자료, 원천징수영수증 1~2월에 놓친 공제 추가 가능
창업·사업자 전환 2026년 5월 본인 직접 근로소득 영수증 + 사업소득 자료 근로·사업소득을 한 번에 정산

⚡ 단기 계약직 중도퇴사, 연말정산 똑똑하게 처리하는 방법

단기 계약직이라도 “한 달만 일해도” 3.3% 원천징수 또는 4대 보험에 가입되면, 사실상 세금 1차 정산이 이미 끝나지만, 연말정산을 통해 추가 환급받을 여지가 있습니다. 특히 2026년 기준으로 2025년 소득이면 1~2월 연말정산 또는 5월 종합소득세 신고를 활용하면 손해를 줄일 수 있습니다.

상황별 연말정산 단계별 가이드

  1. 퇴사 전: 원천징수영수증 확보
    퇴사일 전에 4대 보험·급여 담당 부서에 ‘근로소득 원천징수영수증’을 요청해 PDF 또는 출력본으로 보관하세요. 국세청 정부24 지원 정책 확인에서도 영수증 발급 절차를 안내하고 있습니다.
  2. 재취업한 경우: 현 회사 연말정산 제출
    2026년 1~2월, 현재 회사에서 연말정산을 진행할 때 전 직장 원천징수영수증과 2025년 간소화 서비스 자료를 함께 제출합니다. 이때 보험료, 의료비, 신용·체크카드 사용금액 등 근로기간에 해당하는 부분을 추가로 공제받을 수 있습니다.
  3. 재취업 없이 휴직인 경우: 5월 종합소득세 신고
    2026년 5월 국세청 홈택스에서 ‘종합소득 과세표준 확정신고’ 메뉴를 통해 근로소득을 신고하고, 간소화 서비스에서 2025년 공제 내역을 불러옵니다. 이전 회사에서 1~2월 연말정산을 안 했더라도, 5월 신고로 추가 환급 가능합니다.
  4. 창업·사업자 전환한 경우: 근로+사업소득 합산
    근로소득(원천징수영수증)과 사업소득을 합산해 2026년 5월에 종합소득세로 한 번에 신고하면, 근로소득 공제 + 사업소득 공제를 함께 활용할 수 있습니다.
  5. 홈택스 미발급 시: 회사·세무서에 직접 문의
    퇴사 직후에는 홈택스에 일부 영수증이 아직 올라오지 않을 수 있으니, 원천징수영수증이 누락된 경우 전 직장이나 관할 세무서에 문의 후 별도 제출·정정 신고가 필요합니다.

프로만 아는 꿀팁 공개

PC 온라인 vs 방문(오프라인) 연말정산 신고 방식 비교
구분 PC(온라인) 홈택스 방문(세무서)
장점 시간·공간 제약 없음, 자동 간소화 서비스 활용 가능 직접 설명·문제 상담 가능, 서류 제출이 한 번에 가능
단점 사용법이 낯설면 1~2시간 소요, 오류 발생 시 재작성 필요 영업일·영업시간 제한, 대기 시간 발생
추천 대상 2025년 소득·공제가 단순한 중도퇴사자, 원격 재직자 소득·공제 구조가 복잡한 창업자, 여러 직장 경험자
  • 신용카드 공제는 “근로소득을 제공한 기간”에만 인정되므로, 퇴사 후 1개월 동안 사용한 카드는 공제 대상이 아닙니다.
  • 회사에서 1~2월에 기본 공제만 처리했다면, 5월 종합소득세 신고 시 간소화 서비스에서 추가 공제를 한 번에 반영해 보는 것이 좋습니다.

✅ 실제 사례와 주의사항

서울에서 3개월 단기 계약직으로 일하다 2025년 10월 퇴사한 A 씨는 10월 급여 지급 시 중도퇴사자 연말정산을 받아 소액 세금 환급을 받았습니다. 이후 2025년 12월 다시 재취업해서 2026년 1월 현재 회사 연말정산에 전 직장 영수증을 제출한 결과, 총 20만 원 이상 추가 환급을 받은 사례가 있습니다. 이처럼 1~2개월 단기 계약이라도 정확히 정산하면 예상보다 큰 환급이 가능합니다.

※ 정확한 기준은 아래 ‘신뢰할 수 있는 공식 자료’도 함께 참고하세요.

실제 이용자 후기 모음

  • “계약직 2개월만 일했는데, 5월 신고 통해 10만 원 이상 환급받았다.”
  • “퇴사할 때 영수증을 받지 못해 홈택스에서 직접 발급해 1차 신고 후 추가 공제를 적용했다.”
  • “이전 회사 연말정산을 놓치고, 5월 종합소득세로만 처리해 시간이 걸렸다.”

반드시 피해야 할 함정들

  • 원천징수영수증을 받지 않고 “이번엔 그만두자”라고 넘기는 것
  • 이전 회사와 현재 회사 소득을 합산하지 않아 공제 한도를 초과·미사용하는 것
  • 퇴사 후 1~2년 방치해 5년 소멸시효가 지나기 전까지 미신청 상태를 유지하는 것

🎯 단기 계약직 중도퇴사, 연말정산 최종 체크리스트

단기 계약직이라도 한 번만 정리해 두면 2~3년 후에 갑자기 세금 환급을 놓치는 일을 막을 수 있습니다. 2026년 기준으로 2025년 분 연말정산을 놓치지 않기 위해, 아래 체크리스트를 지금 바로 하나씩 확인해 보세요.

지금 당장 확인할 것들(체크리스트)

  • 2025년 1~12월 근로소득이 있는지 확인(월급 지급 내역)
  • 퇴사한 회사에서 받은 근로소득 원천징수영수증 보유 여부
  • 홈택스 로그인 후 2025년 ‘연말정산 간소화 서비스’에서 자료 조회 가능 여부
  • 재취업 여부에 따라 1~2월 연말정산 또는 5월 종합소득세 신고 경로 선택
  • 병원 영수증, 보험료 납입 내역, 주거·교육 관련 공제 자료 정리

다음 단계 로드맵

  1. 오늘 중 퇴사한 회사에 원천징수영수증 재발급 또는 메일 전송 요청
  2. 국세청 복지로 공식 홈페이지와 정부24에서 연말정산·종합소득세 관련 안내 페이지를 북마크
  3. 2026년 1월(재취업자) 또는 5월(미취업자)에 맞춰 홈택스에서 2025년 간소화 자료와 영수증을 한 번에 불러와 공제 검토

FAQ

단기 계약직 기간만 1~2개월이어도 연말정산이 가능한가요?

네, 가능합니다.

1년 미만 근무라도 4대 보험에 가입됐거나 근로소득세가 3.3% 원천징수된 경우 연말정산 또는 5월 종합소득세 신고를 통해 추가 공제·환급이 가능합니다. 다만 회사에서 중도퇴사자 정산을 기본 위주로만 처리할 수 있으니, 본인이 5월 신고를 통해 추가 공제를 받는 것이 좋습니다. 지금 바로 귀속 연도 근로소득이 있는지 확인해 보세요.

중도퇴사 후 퇴직금과 연말정산은 별도인가요?

네, 별도로 처리됩니다.

퇴직금은 퇴직소득세로 별도 계산되며, 연말정산은 근로소득에 대한 소득·세액공제를 의미합니다. 그래서 “퇴직금이 많았다”고 해서 연말정산이 자동으로 면제되지는 않으며, 근로소득 연말정산